一、物种定义
大鳄龟和小鳄龟的物种定义不同，其中大鳄龟的学名叫真鳄龟，别称鳄甲龟、鳄鱼龟等，在生物分类学上属于动物界、脊索动物门、爬行纲、龟鳖目、鳄龟科、真鳄龟属大型龟类；小鳄龟的学名叫拟鳄龟，别称平鳄龟、蛇鳄龟等，在生物分类学上属于动物界、脊索动物门、爬行纲、龟鳖目、鳄龟科、拟鳄龟属大型龟类。
二、分布范围
大鳄龟和小鳄龟的分布范围不同，其中大鳄龟原产于美国，主产于密西西比河流域；小鳄龟原产于北美洲和中美洲，有北美拟鳄龟、南美拟鳄龟、中美拟鳄龟三个亚种(佛罗里达鳄龟已并入北美拟鳄龟)，北美拟鳄龟原产于加拿大南部及东部，南美拟鳄龟原产于南美洲西北部，中美拟鳄龟原产于墨西哥到洪都拉斯等地。
三、生长速度
大鳄龟和小鳄龟的生长速度不同，其中大鳄龟的生长速度相对较慢，幼龟一年能长5～10厘米，成年后一年只能长4～6厘米，最大个体的背甲可达60～75厘米，体重可达60～75千克；小鳄龟的生长速度相对较快，幼龟一年能长10～15厘米，成年后一年只能长3～5厘米，最大个体的背甲可达30～50厘米，体重可达18～38千克。
四、形态特征
1、头部：大鳄龟的头较尖，上颚似鹰嘴状且钩大；小鳄龟的头较圆，上颚似鹰嘴状且钩小。
2、嘴部：大鳄龟的嘴巴比小鳄龟长，舌头通常呈红色，口腔底部有一个像蠕虫一样的附器。
3、背甲：大鳄龟背甲甲峰明显，有3条棱脊，每块盾片均有突起；小鳄龟背甲甲峰不明显。
4、腹部：大鳄龟的腹部有大量触须；小鳄龟的腹部只有少量触须，腹甲灰白色，无上缘盾。
5、尾部：大鳄龟的尾较长，背面没有锯齿状尾棘；小鳄龟的尾较短小，背面有锯齿状尾棘。